La Consejería de Ministros de Culto es el departamento del Consejo Evangélico de Madrid que se relaciona con los pastores, obreros y responsables de las Iglesias Evangélicas en la Comunidad de Madrid para fomentar la comunión, la formación y el servicio a la sociedad. El Consejero de Ministros de Culto es también presidente de la Asociación de Ministros de la Comunidad de Madrid (AMECAM).

Estos son sus objetivos:

• Crear y supervisar las capellanías en los entes públicos de la Comunidad de Madrid en que fuere necesario.
• Organizar actividades de formación y reciclaje de Ministros de Culto, para que estén al día en cuanto a la legislación nacional o autonómica que les afecta.
• Mantener un código deontológico que acepten todos los Ministros de Culto de las iglesias del CEM.
• Promover actividades de comunión fraternal entre los obreros, responsables y pastores de las iglesias evangélicas de la CAM para fomentar la unidad y el respeto mutuo.
• Organizar actos de reconocimiento y homenajes a aquellos Ministros de Culto que se hallan destacado en el cumplimiento de su ministerio.